江東区中学校体育連盟は、これまで各中学校体育の教科指導や部活動(運動部)に貢献してきました。特に、部活動に関しては近年、関東大会、全国大会等で優勝や上位入賞するなどめざましい活躍をしている部もあります。しかし近年、学校の小規模校化や教員の高齢化等により部活動が持てない教員が増え、希望の部活動が開設できない状況や熱心に指導される顧問の異動でその部が停滞する等の課題があります。
これらの課題に対し区教育委員会では、部活動検討委員会を組織し区独自の振興策として部活動の「外部指導員の積極的採用」、「小規模拠点校の設置」、「強化拠点校の設置」等を進めています。部活動強化拠点校としては、女子サッカー部(四砂中)、カヌー部(大島中)があります。中体連としても各校の部活動が益々発展するよう区教育委員会とも連携を図り取り組んでいます。